SARS-CoV-2: наскільки серйозний варіант B.1.1.529, який тепер називається Omicron

Про варіант B.1.1.529 вперше повідомили ВООЗ з Південної Африки 24^th Листопад 2021 року. Перша відома підтверджена інфекція B.1.1.529 була зі зразка, зібраного 9^th листопад 2021¹. Інше джерело² вказує, що цей варіант вперше був виявлений у зразках, зібраних 11^th листопада 2021 р. у Ботсвані та 14^th Листопад 2021 року в Південній Африці. Відтоді кількість випадків COVID-19 різко зросла майже у всіх провінціях Південної Африки. Як на 27^th У листопаді 2021 року нові випадки цього варіанту також були зареєстровані в Бельгії, Гонконгу, Ізраїлі, Великобританії.³, Німеччині, Італії та Чехії, які за походженням пов’язані з подорожами.  

Дякуємо владі Південної Африки за те, що вони не приділили часу комунікації та обміну відповідною інформацією зі світовою науковою спільнотою, щоб група експертів ВООЗ могла зустрітися 26^th Листопад 2021 року та швидко позначте цей варіант як Варіант, що викликає занепокоєння (VOC). Серйозність справи можна було оцінити з того факту, що B.1.1.529 було визначено варіантом моніторингу (VUM) лише два дні тому, 24^th Листопад 2021 р., перш ніж бути визначений як ЛОС 26^th Листопад 2021 року без визначення першим варіантом, що розглядається (VOI).  

Таблиця: Варіанти занепокоєння SARS-CoV-2 (VOC) станом на 26 листопада 2021 року 

Невідкладність визначення B.1.1.529 як варіанта, що викликає занепокоєння (VOC), була виправданою, оскільки було виявлено, що цей варіант є найбільш розбіжним варіантом SARS-CoV-2 на даний момент. Порівняно з вірусом SARS-CoV-2, спочатку виявленим в Ухані, Китай, він має аж 30 амінокислотних змін, 3 невеликі делеції та 1 невелику вставку в білковий шип. З цих змін 15 знаходяться в домені, що зв’язує рецептор (RBD), частині вірусу, яка дозволяє йому проникати в клітини людини, що призводить до інфекції. Цей варіант також має ряд змін і делецій в інших геномних областях². Мутації настільки великі, що це можна назвати новим штамом, а не варіантом. Неймовірно велика кількість спайкових мутацій означає підвищену можливість втечі від відомих антитіл, що робить цей варіант предметом серйозного занепокоєння.⁵.  

Перехід на нові варіанти є звичайним явищем для коронавірусів. Коронавіруси завжди зазнавали мутації у своєму геномі з надзвичайно високою швидкістю через відсутність коректуючої нуклеазної активності їхніх полімераз; чим більше передача, тим більше помилок реплікації і, отже, більше мутацій накопичується в геномі, що призводить до нових варіантів. Людські коронавіруси створювали мутації, щоб створити нові варіанти в новітній історії. Починаючи з 1966 року, коли був записаний перший епізод, було кілька варіантів епідемій⁶. Але чому така масштабна мутація в одному спалаху? Можливо, тому що варіант B.1.1.529 розвинувся під час хронічної інфекції людини з ослабленим імунітетом, можливо, пацієнта з ВІЛ/СНІДом без лікування⁷.  

Що б не було причиною великих мутацій, якщо швидка швидкість, з якою він поширився в Південній Африці, свідчить про те, що еволюція цього варіанту може мати величезне значення для імунітету, передачі та вірулентності та ефективності існуючих вакцин, які зараз використовуються.  

Про те, чи залишаться існуючі вакцини ефективними проти цього нового варіанту, чи буде більше випадків проривних інфекцій вакцини, наразі мало даних, щоб зробити будь-який висновок. Однак у недавньому дослідженні синтетичний варіант із 20 мутаціями в білку спайка показав майже повну втечу від антитіл.⁷. Це вказує на те, що новий варіант B.1.1.529 з набагато більшою кількістю мутацій може демонструвати значно знижену нейтралізацію антитілами. Однак, здається, що новий варіант є більш переданим завдяки швидкому темпу, з яким він замінив варіант Delta в Південній Африці, хоча поточних даних недостатньо, щоб зробити будь-яку надійну оцінку. Так само неможливо коментувати тяжкість симптомів на цій стадії.  

У зв’язку з тим, що в Європі вже зараз спостерігається надзвичайно велика кількість випадків COVID-19 (через дельта-варіант з високою частотою передачі) протягом останніх кількох тижнів і швидкі темпи, з якими Омікрон (B.1.1.529) варіант поширився в Південній Африці, нещодавно замінивши дельта-варіант, декілька країн Європи, включаючи Великобританію, Німеччину та Італію, наклали обмеження на поїздки на прибуття з Південної Африки та з сусідніх країн, таких як Ботсвана, Малаві, Мозамбік, Замбія та Ангола. Побоюючись найгіршого, Ізраїль має заборонити в’їзд відвідувачам з усіх країн.  

Світ так багато інвестував у розробку та введення вакцин проти COVID-19, щоб захистити людей від пандемії. Питання, яке найбільше хвилює як вчених, так і владу, полягає в тому, чи залишаться головні вакцини проти COVID-19, такі як Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson, також ефективними проти варіанту Omicron (B.1.1.529). . Цьому сприяє той факт, що в Південній Африці були зареєстровані проривні інфекції. Два випадки Гонконгу також отримали дози вакцини⁹. 

Розробка «панкоронавірусних» вакцин¹⁰ (платформи мультивалентних вакцин¹¹), здається, потреба години. Але швидше, можливо, буде можливим швидко виготовити бустерні дози мРНК і ДНК-вакцин, що покривають мутації. Крім того, нещодавно затверджений противірусні засоби (Молнупіравір від Merck і Paxlovid від Pfizer) повинні стати в нагоді для захисту людей від госпіталізації та смерті.   

 *** 

Список використаної літератури:  

1. ВООЗ 2021. Новини – Класифікація Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Варіант занепокоєння. Опубліковано 26 листопада 2021 р. Доступно в Інтернеті за адресою https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Європейський центр профілактики та контролю захворювань. Наслідки появи та поширення SARSCoV-2 B.1.1. 529 варіант занепокоєння (Omicron), для ЄС/ЄЕЗ. 26 листопада 2021 р. ECDC: Стокгольм; 2021. Доступно в Інтернеті за адресою https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. UK Govt 2021. Press release – First UK cases of Omicron variant identified. Published 27 November 2021. Available at https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. ВООЗ, 2021. Відстеження варіантів SARS-CoV-2. Доступний онлайн за адресою https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Томас Пікок: нащадок B.1.1, пов’язаний з Південною Африкою з великою кількістю мутацій Спайка №343. Доступний онлайн за адресою https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Прасад U.2021. Варіанти коронавірусу: що ми знаємо досі. Науковий європейський. Опубліковано 12 липня 2021 року. Доступно в Інтернеті за адресою http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Робота вакцини – що ми знаємо про новий варіант коронавірусу B.1.1.529 і чи варто хвилюватися? Доступний за адресою https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Шмідт Ф., Вайсблюм Ю., Рутковська М. та ін. Високий генетичний бар’єр для втечі поліклональних нейтралізуючих антитіл SARS-CoV-2. Природа (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Сильно мутований варіант коронавірусу змушує вчених напоготові. природа News. Оновлено 27 листопада 2021 р. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Соні Р. 2021. «Панкоронавірусні» вакцини: РНК-полімераза стає мішенню для вакцин. Науковий європейський. Опубліковано 16 листопада 2021 р. Доступно за адресою http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Випуск новин – NIAID видає нові нагороди для фінансування «пан-коронавірусних» вакцин. Опубліковано 28 вересня 2021 р. Доступно за адресою https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***