Варіанти коронавірусу: що ми знаємо досі

Coronaviruses are RNA віруси belonging to coronaviridae family. These віруси display remarkably high rates of errors during replication due to lack of proofreading nuclease activity of their polymerases. In other organisms, the replication errors are corrected but the coronaviruses lack this ability. As a result, replication errors in coronaviruses remain uncorrected and accumulate which in turn act as source of variation and adaptation in these віруси. Thus, it has always been nature of things for the coronaviruses to undergo mutation in their genomes at extremely high rates; more the transmission, more replication errors happen and hence more mutations in the genome leading to more варіанти отже. 

Очевидно, зміна на нову варіанти is not new to коронавіруси. Людська коронавіруси have been building up mutations to new forms in the recent history. There were several варіанти responsible for various epidemics since 1966, when the first episode was recorded.  

The SARS-CoV was the first lethal variant that caused коронавірус epidemic in Guangdong Province of China in 2002. MERS-CoV was the next important variant that caused epidemic in Saudi Arabia in 2012.  

Роман коронавірус SARS-CoV-2, the variant responsible for the current COVID-19 pandemic that started in December 2019 in Wuhan, China and subsequently spread worldwide to become the first коронавірус pandemic in the human history, has continuously undergone further adaptation accumulating mutations in different geographical regions giving rise to several sub-варіанти. These sub-варіанти have minor differences in their genome and the spike proteins and show differences in their transmission rate, virulence and immune escape infectivity.  

Based on the threat that these sub-variants pose, they are grouped into three categories – Варіантів of concern (VOC), Variants of interest or Variants under investigation (VOI) and Variants under monitoring. This grouping of sub-variants is based on evidences related to transmissibility, immunity and severity of infection.    

1. Варіанти занепокоєння (ЛОС) 

Варіанти, що викликають занепокоєння (ЛОС) мають чіткий зв’язок із збільшенням трансмісивності чи вірулентності або зниженням ефективності будь-яких заходів охорони здоров’я, таких як ефективність вакцин, які зараз використовуються. 

2. Варіанти, що цікавлять, або Варіанти, що розслідуються (VOI) 

Відомо, що цікавлять або досліджувані варіанти (VOI) мають генетичні зміни, які можуть вплинути на його передачу, вірулентність або ефективність заходів громадського здоров’я, і визначено, що вони спричиняють значну передачу через громаду.

3. Варіанти на моніторингу  

Варіанти, які контролюються, виявляються як сигнали, і є ознаки того, що вони можуть мати властивості, подібні до ЛОС, але докази можуть бути слабкими. Отже, ці варіанти постійно контролюються на предмет будь-яких змін.  

Це групування є динамічним, тобто підваріанти можуть бути вилучені з однієї групи або включені в будь-яку групу залежно від зміни оцінки загроз з точки зору передачі, імунітету та тяжкості інфекції.  

Ironically, evolution of SAR-CoV-2 currently seems to be ongoing process. Going by the nature of this вірус, so long there is transmission among humans there will be replication errors and mutations. Some mutant or variant may overcome the selection pressure to become more infectious and virulent or escape immune response to make vaccine less effective. Possibly, many more variants will be detected in due course in the regions of higher transmission. Minimising transmission and constant monitoring are the key to containment strategies.  

***

джерела:  

1. Prasad U., 2021. New Strains of SARS-CoV-2 (the вірус responsible for COVID-19): Could ‘Neutralising Antibodies’ Approach be Answer to Rapid Mutation? Scientific European. Posted 23 December 2020. Available online at http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/  

2. ВООЗ, 2021. Відстеження варіантів SARS-CoV-2. Доступний онлайн за адресою https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

3. ECDPC 2021. Варіанти SARS-CoV-2, що викликають занепокоєння, станом на 8 липня 2021 року. Доступно онлайн за адресою https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern 

***