Коронавіруси - це РНК віруси належать до родини coronaviridae. Ці віруси демонструють надзвичайно високі показники помилок під час реплікації через відсутність коректурної нуклеазної активності їхніх полімераз. В інших організмах помилки реплікації виправляються, але коронавіруси не мають цієї здатності. У результаті помилки реплікації в коронавірусах залишаються невиправленими та накопичуються, що, у свою чергу, виступає джерелом варіацій та адаптації в цих віруси. Таким чином, за своєю природою коронавіруси завжди мутували свої геноми з надзвичайно високою швидкістю; більше передачі, більше трапляється помилок реплікації і, отже, більше мутацій у геномі, що призводить до більшого варіанти отже.
Очевидно, зміна на нову варіанти не нова для коронавіруси. Людська коронавіруси створювали мутації до нових форм у новітній історії. Було декілька варіанти відповідальний за різні епідемії з 1966 року, коли був зареєстрований перший епізод.
SARS-CoV був першим смертельним варіантом, який спричинив коронавірус епідемія в китайській провінції Гуандун у 2002 році. MERS-CoV був наступним важливим варіантом, який спричинив епідемію в Саудівській Аравії в 2012 році.
Роман коронавірус SARS-CoV-2, варіант, відповідальний за поточну пандемію COVID-19, яка почалася в грудні 2019 року в Ухані, Китай, а згодом поширилася по всьому світу, став першою коронавірус пандемія в історії людства, постійно зазнавала подальшої адаптації, накопичуючи мутації в різних географічних регіонах, що призвело до кількох під-варіанти. Ці суб-варіанти мають незначні відмінності у своєму геномі та спайкових білках, а також демонструють відмінності у швидкості передачі, вірулентності та імунній інфекційності.
Виходячи з загрози, яку представляють ці підваріанти, вони згруповані в три категорії: Варіантів що викликає занепокоєння (VOC), Варіанти, що представляють інтерес, або Варіанти, що розслідуються (VOI), і Варіанти, що знаходяться під моніторингом. Це групування підваріантів ґрунтується на доказах, пов’язаних із трансмісивністю, імунітетом та тяжкістю інфекції.
- Варіанти занепокоєння (ЛОС)
Варіанти, що викликають занепокоєння (ЛОС) мають чіткий зв’язок із збільшенням трансмісивності чи вірулентності або зниженням ефективності будь-яких заходів охорони здоров’я, таких як ефективність вакцин, які зараз використовуються.
Етикетка ВООЗ | Родовини | Країна вперше виявлена (спільнота) | Рік і місяць вперше виявлені |
Альфа | Б.1.1.7 | Об'єднане Королівство | Вересень 2020 |
бета | Б.1.351 | Південна Африка | Вересень 2020 |
Гамма | P.1 | Brazil | грудня 2020 |
Дельта | Б.1.617.2 | India | грудня 2020 |
- Варіанти, що цікавлять, або Варіанти, що розслідуються (VOI)
Відомо, що цікавлять або досліджувані варіанти (VOI) мають генетичні зміни, які можуть вплинути на його передачу, вірулентність або ефективність заходів громадського здоров’я, і визначено, що вони спричиняють значну передачу через громаду.
Етикетка ВООЗ | Родовини | Країна вперше виявлена (спільнота) | Рік і місяць вперше виявлені |
Eta | Б.1.525 | Нігерія | грудня 2020 |
Іота | Б.1.526 | USA | листопад 2020 |
Каппа | Б.1.617.1 | India | грудня 2020 |
Лямбда | C.37 | Перу | грудня 2020 |
- Варіанти на моніторингу
Варіанти, які контролюються, виявляються як сигнали, і є ознаки того, що вони можуть мати властивості, подібні до ЛОС, але докази можуть бути слабкими. Отже, ці варіанти постійно контролюються на предмет будь-яких змін.
Етикетка ВООЗ | Родовини | Країна вперше виявлена (спільнота) | Рік і місяць вперше виявлені |
Б.1.617.3 | India | лютого 2021 | |
A.23.1+E484K | Об'єднане Королівство | грудня 2020 | |
Лямбда | C.37 | Перу | грудня 2020 |
B.1.351+P384L | Південна Африка | грудня 2020 | |
B.1.1.7+L452R | Об'єднане Королівство | 2021 січня | |
B.1.1.7+S494P | Об'єднане Королівство | 2021 січня | |
C.36+L452R | Єгипет | грудня 2020 | |
AT.1 | Росія | 2021 січня | |
Іота | Б.1.526 | USA | грудня 2020 |
Zeta | P.2 | Brazil | 2021 січня |
AV.1 | Об'єднане Королівство | березня 2021 | |
P.1+P681H | Італія | лютого 2021 | |
Б.1.671.2 + К417Н | Об'єднане Королівство | червні 2021 |
Це групування є динамічним, тобто підваріанти можуть бути вилучені з однієї групи або включені в будь-яку групу залежно від зміни оцінки загроз з точки зору передачі, імунітету та тяжкості інфекції.
За іронією долі, еволюція SAR-CoV-2 зараз, здається, триває. Виходячи з природи цього вірус, поки існує передача серед людей, будуть помилки реплікації та мутації. Деякі мутанти або варіанти можуть подолати тиск селекції, щоб стати більш інфекційними та вірулентними, або уникнути імунної відповіді, щоб зробити вакцину менш ефективною. Можливо, згодом буде виявлено ще багато варіантів у регіонах з підвищеною трансмісією. Зведення до мінімуму передачі та постійний моніторинг є ключем до стратегії стримування.
***
джерела:
- Прасад У., 2021. Нові штами SARS-CoV-2 ( вірус відповідальність за COVID-19): Чи може підхід «нейтралізуючих антитіл» бути відповіддю на швидку мутацію? Науковий європейський. Опубліковано 23 грудня 2020 р. Доступно онлайн за адресою http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/
- ВООЗ, 2021. Відстеження варіантів SARS-CoV-2. Доступний онлайн за адресою https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ECDPC 2021. Варіанти SARS-CoV-2, що викликають занепокоєння, станом на 8 липня 2021 року. Доступно онлайн за адресою https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
***